NEJM

Klinické metagenomové sekvenování v diagnostice meningitidy a encefalitidy

Metagenomové NSG (next-generation sequencing) mozkomíšního moku má velký potenciál v identifikaci mnoha patogenů, a to díky jednomu testu.
Byla vytvořena 1roční multicentrická prospektivní studie, která se zaměřila na diagnostiku infekčních meningitid a encefalitid s využitím metagenomového NGS z mozkomíšního moku u hospitalizovaných pacientů. Pozitivní výsledky patogenů na z metagenomového NGS byly ověřeny laboratorním testováním.
Ve studii bylo 204 dětských i dospělých pacientů z 8 nemocnic. Pacienti byli vážně nemocní, 48,5 % muselo být přijato na JIP. 30denní mortalita mezi pacienty ve studii byla 11,3 %. Bylo diagnostikováno 58 infekcí nervového systému z 57 pacientů (27,9 %). Mezi těmito 58 infekcí se pomocí metagenomové NGS identifikovalo dalších 13 (22 %), které předtím nebyly identifikovány klinickým testováním. Mezi zbývajícím 45 infekcemi (78 %) se pomocí metagenomové NGS odhalilo 19 souběžných infekcí. Z 26 infekcí, které nebyly identifikovány pomocí NGS, bylo 11 diagnostikováno sérologicky, z jiného vzorku než mozkomíšního moku bylo diagnostikováno 7 infekcí. 8 negativních v metagenomové NSG mělo nízké titry patogenů v mozkomíšním moku. U některých pacientů se díky metagenomovému testování určila správná diagnóza a tedy i léčba.
Rutinní mikrobiologické testování není vždy schopné detekovat neuroinvazivní patogeny. V této studii se ukázalo, že provádění metagenomové NGS z mozkomíšního moku může vést k lepší diagnostice pacientů s meningitidou a encefalitidou.
https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa1803396

Bibliografické údaje: